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GMP規定了食品加工企業必須達到的基本衛生要求，包括環境要求、硬件設施要求、衛生管理要求等。在對管理文件、質量記錄等管理要求方面，GMP與ISO9000族標準的要求是一致的。
SSOP是依據GMP的要求而制定的衛生管理作業文件，相當于ISO9000管理體系中有關清洗、消毒、衛生控制等方面的作業指導書。
HACCP是建立在GMP、SSOP基礎上的預防性的食品安全控制體系。其控制食品安全危害、將不合格因素消滅在過程中，體現的預防性與ISO9000族標準的過程控制、持續改進、糾正體系的預防性是一致的。ISO9000質量管理體系側重于軟件要求，即管理文件化，強調最大限度滿足顧客要求，對不合格產品強調的是糾正；GMP、SSOP、HACCP、ISO22000標準除要求管理文件化外，側重于對硬件的要求，強調保證食品安全，強調危害因素控制、消滅在過程中。
ISO22000標準采用了ISO9000族標準體系結構，在食品危害風險識別、確定及體系管理方面，參照了食品法典委員會頒布的《食品衛生通則》中有關HACCP體系和應用指南部分。ISO9000質量體系文件是按照從上到下的次序建立的，即從質量手冊到程序文件的到作業指導書到記錄等其他質量文件；HACCP的文件是從下而上，從危害分析到SSOP到GMP，最后形成一個核心產物，即HACCP計劃。
ISO9000質量體系所控制的范圍較大，HACCP控制的內容是ISO9000質量體系的質量目標之一，但ISO9000質量體系的沒有危害分析的過程控制方法，因此食品加工企業僅靠建立ISO9000質量體系很難達到食品安全的預防性控制要求。HACCP是建立在GMP、SSOP基礎之上的控制危害的預防性體系，與質量管理體系相比，它的主要目標是食品安全，因此可以將管理重點放在影響產品安全的關鍵加工點上，在預防方面顯得更為有效，是食品安全預防性控制的唯一有效方法，填補了ISO9000質量體系在食品安全的預防性控制方面的缺點。
目前，ISO9000、ISO22000標準是推薦性標準，企業自愿實施。GMP、SSOP、HACCP的多數內容已經成為政府的強制性要求，企業必須達到。
